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研发服务

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测序分析服务

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华仁医学

 

• 测序分析服务

10xGenomics单细胞转录组测序

单细胞水平的高通量基因表达谱分析,对复杂细胞群体深入分析,表征单个细胞的表达谱;可同时检测CRISPR干扰、细胞表面蛋白,避免单个细胞的异质性生物学信息被大量细胞的均质化掩盖。

 

 

• 基因组层次研究服务

 

微生物种群鉴定测序(16S/18S/ITS)

自然界中的微生物多如恒河沙数,且其中绝大多数无法在实验室培养观察。目前所知道的微生物种数已超过了十万种,这还是一个正在急剧扩大着的数字。DNA测序鉴定方法已经被证明比传统的生化分型和表型分型方法更加准确、快捷,不依赖菌种本身特点,对所有菌种均可使用。凭借先进的测序仪器和多年的微生物检测经验,为您可提供快速、高效、权威的微生物检测服务,包括细菌16SrDNA测序、真菌18SrDNA测序、ITS测序。

 

• 转录组测序研究服务

 

lncRNA测序

长链非编码RNA(longnoncodingRNA,lncRNA)是指长度在200~100000nt之间不具有蛋白编码功能的RNA分子。它们存在带polyA尾和不带polyA尾两种形式,具有跨物种的低保守性,组织特异性表达和丰度低等特点。lncRNA的种类远远超过编码RNA,保守估计哺乳动物基因组序列中4%~9%的序列产生lncRNA转录本,而相应的蛋白编码RNA的比例仅是1%~5%。目前研究提示lncRNA的功能机制主要包括参与转录调控、转录后调控、蛋白质运输和mRNA降解。lncRNA已经成为非编码RNA研究领域的一个热点,借助高通量测序,研究人员能够快速获得与疾病或者特定生物学过程相关的lncRNA并进行深入研究。

smallRNA测序

smallRNA是生命活动重要的调控因子,在基因表达调控、生物个体发育、代谢及疾病的发生等生理过程中起着重要的作用,包括miRNA、piRNA和siRNA。

环状RNA测序

环状RNA测序是新兴的转录组测序技术。过去普遍认为细胞内的非编码RNA多以线型存在,近年来越来越多的研究发现,环状RNA在哺乳动物细胞内的表达量远高于普遍认识水平。环状RNA可以参与基因的表达调控,例如封闭miRNA的作用、调节本位基因的表达等,是长链非编码RNA研究中的一个新的研究热点。

 

• 表观遗传学研究服务

研究人员可以利用MeDIP-Seq和hMeDIP-Seq技术快速有效地寻找基因组上的甲基化区域,从而比较不同细胞、组织或疾病样本间的DNA甲基化修饰模式的差异,为生物学研究或临床应用方案提供理论证据。

 

MeDIP甲基化测序

MeDIP-Seq(MethylatedDNAImmunoprecipitationSequencing)测序是基于抗体富集原理进行测序的全基因组甲基化检测技术,采用甲基化DNA免疫共沉淀技术,通过5'-甲基胞嘧啶(5mC)抗体特异性富集基因组上发生甲基化的DNA片段,然后通过高通量测序可以在全基因组水平上进行高精度的CpG密集的高甲基化区域研究。

hMeDIP-Seq(hydroxymethylcytosineDNAImmunoprecipitationSequencing)测序基于原理同MeDIP-Seq。利用5'-羟甲基胞嘧啶(5hmC)抗体特异性富集基因组上发生甲基化的DNA片段。5hmC是新发现的一种的修饰碱基,由10-11易位(TET)家族的酶通过氧化5mC产生的。5hmC不仅能够降低MeCP蛋白的甲基化结合结构域(MBD)与甲基化DNA的亲和性,具有潜在的参与基因表达调控的转录调节功能,而且参与了DNA去甲基化过程。

研究人员可以利用MeDIP-Seq和hMeDIP-Seq技术快速有效地寻找基因组上的甲基化区域,从而比较不同细胞、组织或疾病样本间的DNA甲基化修饰模式的差异,为生物学研究或临床应用方案提供理论证据。

 

mRNA甲基化测序

表观遗传修饰不仅发生在基因组层面(DNA甲基化),同样在转录组层面也有表观修饰,并且其中重要的转录后调控功能。早在四十年前,人们就发现信使RNA上存在着腺嘌呤上的甲基化修饰(m6A)。这种m6A修饰非常普遍,出现频率大约是3-5个残基/mRNA。m6A甲基化修饰是可逆的,而且可能受到了动态调控。m6A的甲基化和去甲基化受到甲基化酶复合体METLE3,METLE14,WTAP和去甲基化酶FTO调控。m6A在人类和小鼠的转录组中非常保守,这说明这种修饰很可能具有重要的功能。m6A与mRNA剪切,生物钟调节,mRNA的稳定性相关。此外,m6A通过招募YTHDF2诱导mRNA从翻译中的核糖体转移到细胞质的P-body,并在那里被降解。而且mRNA的降解程度与其甲基化位点数有关。

对于mRNA甲基化的检测,目前采用:甲基化mRNA富集并结合高通量测序(MeRIP-Seq,m6A-specificmethylatedRNAimmunoprecipitationwithnextgenerationsequencing)的方法。MeRIP-Seq的原理是:由于在哺乳动物中mRNA甲基化一般发生在腺嘌呤的第6位氮原子上,所以可通过特异性结合m6A抗体富集高甲基化的mRNA片段,并结合第二代高通量测序,对富集到的mRNA片段进行测序,从而检测全转录组范围内的甲基化位点。