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虚拟筛选
虚拟筛选技术是一种基于计算机模拟的技术，主要用于搜索数据库中的小分子化合物，以确定哪些最有可能与药物靶点结合并发挥功能。与传统的实验高通量筛选（HTS）相比，虚拟筛选是一种更直接、合理的药物发现方法，具有成本低，筛选有效的优势。
在药物分子研发过程中，虚拟筛选技术可以对大量化合物数据库的筛选，为发现新的活性化合物提供一种快速、经济的研究方法。这对于无法进行高通量筛选实验的小微企业来讲，是获得有效活性分子的重要方法。目前，对于高通量虚拟筛选方法的优化和改进已经使筛选的命中率显著提升。具体来讲，传统的实验高通量筛选命中率大概在0.01%-0.14%之间，而目的明确的虚拟筛选命中率可以达到1%-40%。
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虚拟筛选的分子 |
作用靶点 |
公 司 |
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Dorzolamid |
碳酸酐酶 |
默沙东制药 |
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Relenza |
神经氨酸苷酶 |
Biota |
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Ro466240 |
凝血酶 |
罗氏 |
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Saquinavir |
HIV蛋白酶 |
罗氏 |
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Ag85, AG337, AG331 |
胸苷酸合成酶 |
Agouron |
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Gleveca |
PTK |
诺华制药 |
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华仁医学科技具有深厚的分子模拟技术经验，专业的技术人员团队，完备的化合物数据库，可以为用户提供基于靶点或小分子的虚拟筛选服务，进而选择在实验中可能具有潜在活性的化合物分子。
分子对接是结构生物学和计算机辅助药物设计中最重要的方法之一，目的是预测药物靶点与小分子化合物之间的结合模式和亲和力大小。分子对接的主要思路是通过优化结合位点的空间，疏水作用和静电作用等参数，使小分子化合物结合到靶点的活性位点，并通过分子对接的打分函数来计算小分子与靶点之间的亲和力大小。
分子对接在药物设计中可以用于对大型化合物数据库的筛选，基于打分函数对筛选结果进行排序，并解释化合物分子如何抑制/激活药物靶点的机制，这在药物设计的先导化合物优化过程中具有非常重要的作用。目前，基于分子对接的虚拟筛选（DBVS）方法，已经成为药物设计和研发的必要工具，DBVS方法的应用可以快速发现具有全新结构的活性化合物分子。
虚拟筛选方法主要由以下步骤组成：1、药物的相似性筛选；2、基于分子对接的虚拟筛选；3、由经验丰富的技术人员进行人工筛选。这样可以大大提高虚拟筛选获得活性化合物的几率。
人工筛选是在打分函数的基础之上，结合化合物与靶点的结合位点、相互作用模式以及与现有活性分子的构效关系，选择具有较高亲和力的化合物作为候选。在人工筛选的过程中，尽量保证化合物与重要或保守的氨基酸之间的相互作用，并扩展更多的化合物核心结构作为候选，最后选择排名靠前的化合物进行活性测试。
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